Dans sa Politique Agricole Commune (PAC) , l’UE incorpore des règles relatives à la santé animale.
La question de la santé animale a été évoquée pour la première fois dans une déclaration à l'occasion de la Conférence Intergouvernementale sur l'union politique (1991-1992). Depuis, il a été demandé aux Institutions de prendre en compte la santé animale lors des processus décisionnels dans les domaines de la politique agricole, du transport, du marché intérieur et de la recherche.
Bien qu'un Protocole annexé au Traité d'Amsterdam précise les obligations des Institutions européennes et des Etats membres en matière de santé animale, le Marché Intérieur et l'arrêt des contrôles vétérinaires aux frontières des Etats membres ont mené à de pires conditions de transport pour les animaux.
Remarques
Le Parlement Européen a établi un intergroupe de travail concernant la santé animale, celui-ci critique les règles existantes.